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尊龙凯时的CUT&Tag技术在生物医疗中的应用探索

来源:太叔茂茜 日期:2025-03-10

CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)是一种前沿的DNA-蛋白互作研究技术,专门用于探究转录因子和组蛋白修饰在全基因组范围内的结合位点。其核心原理是利用抗体识别目标蛋白或特定染色质修饰,并通过Tn5转座酶(Tagmentase)在目标位点高效进行DNA片段化及文库构建。该技术由Stephen Henikoff团队于2019年研发,作为ChIP-Seq(免疫共沉淀测序)的一项改进和替代方法。得益于其高灵敏度、低背景噪声和对细胞量的低需求,CUT&Tag技术现已成为揭示基因调控机制、解析染色质状态以及推动精准医学研究的关键工具。它在表观遗传学研究、转录因子结合位点分析、疾病机制解析、药物筛选及单细胞基因调控研究等多个领域得到了广泛应用。

尊龙凯时的CUT&Tag技术在生物医疗中的应用探索

基于先进的Protein A/G-Tn5融合蛋白体系与高通量测序平台,尊龙凯时生物科技提供专业的CUT&Tag技术服务,涵盖样本制备、文库构建、高通量测序及生物信息学分析的全流程。我们的技术团队拥有丰富的表观基因组学经验,可高效、精准地解析蛋白质与DNA的相互作用,帮助科研人员探究基因调控的深层机制。

一、CUT&Tag技术背景

组蛋白通过形成核小体来压实和保护DNA,其修饰(例如乙酰化、甲基化)与DNA甲基化共同调控基因表达。这些修饰状态及其动态变化对于维持细胞功能至关重要,且与多种疾病的发生发展密切相关。因此,理解组蛋白与DNA之间复杂而精准的相互作用,对于揭示正常细胞过程和疾病状态,特别是癌症,具有重要的科学和临床意义。此外,蛋白质-DNA相互作用是基因转录调控的核心,且是启动基因转录的前提。针对这些复杂的相互作用机制,科学家们开发了多种研究方法,包括凝胶阻滞、酵母双杂交、ChIP-Seq以及CUT&Tag等,其中后者逐渐成为研究蛋白质-DNA相互作用和染色质状态的前沿工具。

二、CUT&Tag与ChIP-Seq技术比较

CHIP-seq(染色质免疫共沉淀测序)通过染色质免疫共沉淀技术(ChIP)特异性富集目的蛋白结合的DNA片段,并对其进行纯化与文库构建,最终进行高通量测序。然而,该技术存在细胞起始量要求高、容易出现假阴性/假阳性、实验条件难以选择、高度依赖特异性抗体、重复性差、信噪比低等缺陷。

相比之下,CUT&Tag技术利用Protein A/G-Tn5融合蛋白直接与目标蛋白结合,省去了传统方法的交联步骤,显著降低了背景噪声,实现了高分辨率的结合位点检测。该技术的关键步骤包括:结合细胞膜上的糖蛋白,提取细胞核,进行特定抗体孵育以消除非特异性结合,再通过Protein A/G-Tn5融合蛋白将转座酶精准落位于目标DNA区域。最终,通过Illumina平台进行高通量测序,并结合生物信息学工具进行后续分析,全面解析转录因子结合位点及其功能。

三、CUT&Tag技术亮点

CUT&Tag技术具有以下亮点:

  • 低细胞量需求:仅需少量细胞(甚至单细胞)即可进行分析。
  • 高灵敏度:背景噪声低,信噪比高。
  • 高分辨率:可准确定位转录因子和组蛋白修饰的结合区域。
  • 实验周期短:与ChIP-Seq相比,实验流程更简化,时间更短。

四、CUT&Tag文献应用

通过CUT&Tag技术,研究人员揭示了H3K18la在胰腺导管腺癌(PDAC)进程中的调控机制。胰腺癌作为一种高度恶性的消化系统肿瘤,其治疗尚有待改进。研究表明,组蛋白乳酸化与PDAC患者的不良预后密切相关,且该研究进一步探讨了代谢重编程如何影响组蛋白乳酸化,从而影响PDAC的增殖与转移。

尊龙凯时生物科技致力于为客户提供一站式的CUT&Tag技术服务,助力科研人员深入解析染色质状态与基因调控的关系,为疾病机制研究和药物开发提供强有力的支持。我们的服务涵盖从样本准备、抗体优化到高通量测序及数据分析的全流程支持,确保为您提供高质量的分析数据。

如需进一步了解关于CUT&Tag的专业服务,欢迎联系尊龙凯时生物科技,我们将竭诚为您提供个性化的解决方案。

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